Амоксицилін у кнурів: у двох порід мікробіом відновлюється, у дюрока — ні
Дослідження на 103 кнурах трьох порід показало, що амоксицилін (100 мг/кг корму, 5 днів) суттєво знижує альфа-різноманіття кишкової мікробіоти у великої білої та ландрасу, але не у дюрока. У дюрока мікробіом виявився стійким до антибіотика. Після відміни препарату LW і LAN частково відновлюються.
Амоксицилін — найпоширеніший антибіотик у свинарстві: дешевий, добре всмоктується при пероральному застосуванні, ефективний проти бешихи, респіраторних інфекцій, ентеритів і діарей. Але він б'є по корисній мікробіоті кишечника, викликаючи дисбіоз, зниження колонізаційної резистентності та селекцію резистентних штамів. Досліджень на кнурах-плідниках, тим паче з ранніми точками відбору проб, досі бракувало.
Дизайн. 103 кнури трьох порід: 40 велика біла (LW), 47 ландрас (LAN), 16 дюрок (DUR). Вік 50–55 днів на старті. Утримання однакове, годівля двічі на день, антибіотиків до експерименту не давали. Амоксицилін вводили в корм у дозі 100 мг/кг з 3-го по 7-й день. Проби калу брали на D0 (до), D7 (під час) і D14 (після відміни). Секвенування 16S rRNA (V3-V4).
Результати.
- Альфа-різноманіття (observed species, індекс Шеннона) у LW і LAN на D7 значно впало, на D14 — часткове відновлення. У DUR змін не було взагалі.
- PCoA: проби D7 формують окремий кластер, відмінний від D0 і D14 — тобто структура угруповання під час антибіотика змінюється різко, а після відміни повертається ближче до вихідної.
- На рівні роду: у LW і LAN домінували Lactobacillus і Streptococcus, їх частка зростала під час лікування і падала після відміни. У DUR переважали Prevotella і Lactobacillus.
- Функціональне прогнозування (KEGG) показало зсуви в шляхах метаболізму та лікарської резистентності.
Що це означає для практики. Реакція мікробіоти на амоксицилін породоспецифічна. LW і LAN після 7-денного курсу відновлюються лише частково за два тижні. DUR виявився стійким — можливо, через інший вихідний склад мікробіому (більше Prevotella). Це аргумент враховувати породу при призначенні антибіотиків і планувати відновлювальні заходи (пробіотики, пребіотики) для LW і LAN після курсу. Для дюрока ризик дисбіозу від короткого курсу амоксициліну нижчий.
Обмеження: мала вибірка DUR (16 голів), короткий період спостереження (14 днів), лише фекальна мікробіота без пристінкової. Довгострокове відновлення і вплив на продуктивність кнурів не оцінювали.