Перші повні мітогеноми двох бліх-переносників чуми з Тибету: що це змінює для практики
Китайські дослідники вперше секвенували повні мітохондріальні геноми двох домінантних видів бліх у вогнищі чуми на Тибетському плато — Callopsylla dolabris та Oropsylla silantiewi. Це дало нові дані про їх еволюційні зв'язки та підтвердило, що родина Ceratophyllidae не є монофілетичною. Дані важливі для уточнення філогенії бліх і моніторингу переносників.
Китайські дослідники з Університету Далі вперше секвенували повні мітохондріальні геноми двох видів бліх — Callopsylla dolabris та Oropsylla silantiewi. Обидва види є домінантними ектопаразитами гімалайського бабака у природному вогнищі чуми на Тибетському плато і становлять близько 90% усіх бліх у цьому регіоні. Вони мають високі показники природної інфікованості Yersinia pestis і відіграють ключову роль у циркуляції збудника.
Що зробили Зразки зібрали у повіті Цзючжі (провінція Цинхай, висота ~4000 м). Використали 51 особину C. dolabris та 53 особини O. silantiewi. Секвенування провели на Illumina NovaSeq, глибина покриття мітогеномів — 916× та 1341× відповідно. Повні мітогеноми депоновано в GenBank (PX993261 та PX979559).
Ключові результати
- Розмір мітогеномів: 17 104 bp (C. dolabris) та 15 914 bp (O. silantiewi).
- Обидва геноми мають виражений AT-зміщення та перевагу кодонів, що закінчуються на A/U.
- Аналіз селективного тиску (Ka/Ks) показав, що мітохондріальні білок-кодуючі гени бліх перебувають переважно під дією очищувального добору.
- Філогенетичний аналіз на основі 39 мітогеномів (36 видів бліх) підтвердив монофілію надродини Ceratophylloidea.
- Родина Ceratophyllidae, до якої відносять обидва нові види, не утворила строго монофілетичну групу. Те саме стосується Leptopsyllidae.
- Родина Pulicidae підтверджена як монофілетична клада з високою підтримкою.
Практичне значення Для ветеринарії та епідеміології це означає наступне. По-перше, молекулярна ідентифікація бліх за повними мітогеномами може доповнювати морфологічну діагностику, яка часто ускладнена пошкодженням зразків або відсутністю статевих ознак. По-друге, уточнена філогенія важлива для розуміння, які саме види бліх у природних вогнищах є найбільш небезпечними переносниками. Те, що Ceratophyllidae не є монофілетичною групою, свідчить про необхідність перегляду таксономічної класифікації, що може вплинути на майбутні визначники.
Обмеження: дані отримані з одного географічного регіону, тому для підтвердження внутрішньовидової варіабельності потрібні додаткові вибірки з інших частин ареалу.