Мікробіом міжпальцевої шкіри ягнят: перші 15 днів життя
У ягнят 0–15 днів міжпальцева шкіра заселяється стабільним «ядром» зі стафілококів і коринебактерій, а склад мікробіому різко відрізняється залежно від віку й місця утримання. Dichelobacter nodosus не знайшли в жодного ягняти, але Porphyromonas були вже при народженні.
Дослідження з однієї комерційної вівцеферми (554 вівцематки, низький рівень кульгавості — 50 вівцематок за рік). Взяли змиви з усіх чотирьох кінцівок у 25 здорових ягнят віком 0–15 днів під час одного візиту в березні 2022 року. Склад бактеріальної спільноти визначали секвенуванням 16S rRNA (V3–V4), загальне бактеріальне навантаження (TBL) і наявність D. nodosus — кількісною ПЛР (TaqMan на ген rpoD).
Що знайшли:
- Склад мікробіому виразно відрізнявся між групами «вік + місце утримання». У новонароджених спільноти були щільніше згруповані, ніж у старших ягнят.
- Загальне бактеріальне навантаження було вищим у ягнят віком від 1 дня і старше.
- У всіх групах виявили стабільне раннє «ядро» мікробіому з домінуванням Staphylococcaceae і Corynebacteriaceae. Але домінантні ампліконові варіанти послідовностей (ASV) відрізнялися залежно від групи.
- D. nodosus не виявили в жодного ягняти.
- ASV, віднесені до роду Porphyromonas, знайшли в міжпальцевій шкірі вже при народженні.
Чому це важливо для практики:
У дорослих вівцематок склад міжпальцевого мікробіому, зокрема наявність Porphyromonas spp., передбачає подальші випадки кульгавості. Тепер відомо, що ці бактерії присутні вже в перші дні життя — тобто потенційне вікно для втручання (менеджмент, гігієна, утримання) може бути дуже раннім.
D. nodosus при народженні немає — це узгоджується з попередніми даними, що збудник з'являється протягом першої доби лише в отарах, де вівцематки кульгаві на фоотрот. У цьому господарстві рівень кульгавості був низький, і збудника не знайшли взагалі.
Раніше фермери повідомляли, що ягнята частіше мають початкову стадію фоотроту (міжпальцевий дерматит), а тяжкі ураження в них рідші, ніж у вівцематок. Це наводить на думку про різний патогенез у різних вікових групах — можливо, через повторний вплив і хронічне запалення.
Дослідження дає базову лінію для майбутніх робіт: як формується мікробіом міжпальцевої шкіри, чи впливає ранній вплив мікробів на ризик фоотроту протягом життя. Обмеження — одна ферма, мала вибірка (25 ягнят), зріз в один момент часу.