У Перу всі 50 ізолятів Enterobacterales від індиків і підстилки виявилися мультирезистентними

Дослідження з Ліми (Перу) — зрізовий опис у невеликому напівтехнізованому господарстві на 8000 індиків, яке утримує птицю в закритих приміщеннях і використовує азитроміцин як стимулятор росту. Ферма розташована в зоні змішаного тваринництва — поруч свині, ВРХ, інша птиця.

Що зібрали. 25 зразків: 19 клоакальних мазків від окремих індиків і 6 зразків підстилки з пташників. З кожного зразка брали до двох ізолятів, якщо колонії відрізнялися морфологічно. Разом — 50 ізолятів: 38 (76%) з клоаки, 12 (24%) з довкілля.

Склад. E. coli — 39 (78%), Klebsiella spp. — 7 (14%), Citrobacter spp. — 4 (8%). Ідентифікація — біохімія (TSI, LIA, цитрат, SIM), відбір — лактозоферментуючі, оксидазонегативні колонії на MacConkey.

Резистентність. Диско-дифузійний метод Кірбі–Бауера, 27 препаратів, інтерпретація за CLSI, для азитроміцину — EUCAST. Проміжні результати віднесли до чутливих. Контрольний штам — E. coli ATCC 25922.

Усі 50 ізолятів — MDR. Найчастіший профіль: канаміцин + тетрациклін + неоміцин + цефуроксим + амоксицилін–клавуланат. Один ізолят E. coli був резистентний до 18 антимікробних препаратів. Ізолят Citrobacter spp. з довкілля — до 17, включно з іміпенемом.

Кластери. Множинний аналіз відповідностей (MCA) + k-means дав структуровану картину: перші дві осі пояснюють 45,3% інерції, виділено три кластери з різними спектрами резистентності. Один кластер містив усі карбапенем-резистентні ізоляти й мав найширший профіль.

Для практики. Карбапенем-резистентний Citrobacter у підстилці — це вже не просто кишкова флора птиці, а сигнал про циркуляцію резистентності в середовищі утримання. Комбінація MCA + кластеризація дає більше, ніж простий підрахунок частот окремих препаратів: вона показує, які профілі ходять разом і де формується найширша резистентність. Для господарств такого типу це аргумент на користь моніторингу не лише клінічних тварин, а й підстилки, води та ґрунту.