Кишкові бактерії виявилися заразнішими, ніж думали: нові штами пов’язані з раком і діабетом
Дослідники з Віденського університету знайшли приховані популяції бактерій усередині відомих видів. Деякі з них пов’язані з віком, колоректальним раком, запальними хворобами кишки та діабетом 2 типу. Це означає, що мікробіом може передаватися між людьми та континентами, а лікування можна буде націлювати точніше — на конкретні штами, а не на весь вид.
Ми звикли думати про мікробіом як про щось індивідуальне, що формується нашим харчуванням і способом життя. Нове дослідження у Nature показує: кишкові бактерії можуть бути значно більш «заразними», ніж вважалося.
Команда з Віденського університету застосувала метод «зворотної екології» — аналіз геномів, щоб зрозуміти, як бактерії адаптувалися до умов у кишківнику. Вони проаналізували тисячі ізолятів і величезні масиви метагеномних даних від людей з різних країн, різного віку та стану здоров’я.
Що знайшли
Виявилося, що багато відомих видів кишкових бактерій — це не одна однорідна група. Усередині кожного виду є кілька еволюційно різних ліній, які адаптовані до різних умов у кишківнику. Ці лінії можна відрізнити за генетичними маркерами так званих «селективних хвиль» — коли корисна мутація дозволяє одній популяції стати домінуючою.
Ключове для практики: деякі з цих прихованих популяцій чітко асоціюються з конкретними захворюваннями. Йдеться про:
- колоректальний рак
- запальні хвороби кишки (ВЗК)
- діабет 2 типу
- похилий вік
Раніше ці асоціації «розмивалися», бо всіх бактерій одного виду рахували разом. Тепер, коли дивишся на рівень окремих штамів, зв’язок стає набагато чіткішим.
Ще один несподіваний висновок
Деякі особливо конкурентні популяції бактерій поширюються між людьми та континентами дуже швидко — протягом кількох десятиліть. Раніше таку динаміку бачили лише у патогенів. Для звичайних кишкових бактерій це новина.
Це означає, що мікробіом формується не лише дієтою чи антибіотиками. Передача бактерій від людини до людини може бути важливим фактором, який визначає, які популяції закріплюються у кишківнику.
Що це дає в клініці
Замість того щоб вважати весь вид бактерій «поганим» чи «хорошим», ми зможемо націлюватись на конкретні штами. Це покращить точність діагностичних біомаркерів і дозволить розробляти терапії, які пригнічують шкідливі популяції та підтримують корисні.
Наступний крок дослідників — з’ясувати, які саме гени відрізняють ці популяції та які біологічні функції стоять за цими відмінностями.